Manuel Muñoz nació en Tegucigalpa, Honduras. Estudió dirección cinematográfica en la Universidad del Cine y la Universidad Torcuato Di Tella de Buenos Aires. Becario del programa Art School Alliance con la Universidad de Bellas Artes de Hamburgo. Sus cortometrajes Rubicón y Tegucigalpa no tiene Street View se estrenaron en Visions du Réel y FICUNAM respectivamente. En 2021 desarrolló su su primer largometraje, Los Reinos en el marco de la BIENAL y actualmente trabaja en su segundo, Fusil Olímpico. Forma parte de Sinroncar Cine, una compañía de cine independiente con sede en Tegucigalpa, Buenos Aires y Ciudad de México.